La subhasta és una de les peculiaritats i el major senyal d'identitat del mercat dels encants. De caràcter públic, la subhasta es realitza els dilluns, dimecres i divendres, i comença a les 7:15 del matí fins a les 9:00 aproximadament. Es realitza al pati central del mercat i se subhasten els lots exposats en les quaranta parades habilitades a tal activitat. Els compradors liciten per la totalitat del lot exposat, que a partir de les 9:00, serà detallat al públic en general. Normalment els lots estan composts de mobles antics i de segona mà, estocs de fàbriques, tendes, roba, sabates, eines, etc., nous o usats. Evidentment a primera hora és quan podem trobar els objectes més curiosos ja que a mesura que transcorre la subhasta, els lots es van detallant i els primers objectes a vendre's solen ser els mes cobejats. 

En tractar-se d'una subhasta de caràcter públic, qualsevol persona pot comprar en ella. Sempre que hagi estat registrat a aquest efecte pel subastador i havent de retirar el lot adquirit abans de les 9:00 no podent desenvolupar dins del mercat cap activitat comercial. La subhasta es realitza en duros i arrenca de zero al millor postor, l'última paraula sempre la té el venedor.

Una vegada s'ha subhastat un lot, si aquest ha estat adquirit per un comerciant degudament censat al mercat, ja es pot començar a detallar. Mai es pot comprar gens en un lot que no hagi estat prèviament subhastat.

El mercat dels encants és l'únic mercat d'Europa en el qual funciona aquesta modalitat de venda.